Dynamic exploration and editing of KEGG pathway diagrams

نویسندگان
چکیده

برای دانلود رایگان متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Dynamic exploration and editing of KEGG pathway diagrams

MOTIVATION The Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) Pathway database is a very valuable information resource for researchers in the fields of life sciences. It contains metabolic and regulatory processes in the form of wiring diagrams, which can be used for browsing and information retrieval as well as a base for modeling and simulation. Thus it helps in understanding biological proce...

متن کامل

KEGGParser: parsing and editing KEGG pathway maps in Matlab

SUMMARY KEGG pathway database is a collection of manually drawn pathway maps accompanied with KGML format files intended for use in automatic analysis. KGML files, however, do not contain the required information for complete reproduction of all the events indicated in the static image of a pathway map. Several parsers and editors of KEGG pathways exist for processing KGML files. We introduce K...

متن کامل

diagnostic and developmental potentials of dynamic assessment for writing skill

این پایان نامه بدنبال بررسی کاربرد ارزیابی مستمر در یک محیط یادگیری زبان دوم از طریق طرح چهار سوال تحقیق زیر بود: (1) درک توانایی های فراگیران زمانیکه که از طریق برآورد عملکرد مستقل آنها امکان پذیر نباشد اما در طول جلسات ارزیابی مستمر مشخص شوند; (2) امکان تقویت توانایی های فراگیران از طریق ارزیابی مستمر; (3) سودمندی ارزیابی مستمر در هدایت آموزش فردی به سمتی که به منطقه ی تقریبی رشد افراد حساس ا...

15 صفحه اول

Deductive Calculation Library for KEGG Pathway Simulation

KEGG, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, project consists of three types of data, pathways, hierarchies, and binary relations, that are used to represent biological knowledge. We present here a C++ library for e cient calculation of possible pathways from binary relations. In practice, the library is used to calculate metabolic pathways from the substrate-product relations of enzymes stor...

متن کامل

Exploration of Non-seen Diagrams

This paper describes an exploratory experiment investigating access to non-seen diagrams with a view to presenting such diagrams through an auditory interface. Sighted individuals asked questions of a human experimenter about diagrams they could not see, in order to learn about them. The dialogue was recorded and analysed. The analysis resulted in an insight into the strategies used by the part...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Bioinformatics

سال: 2006

ISSN: 1367-4803,1460-2059

DOI: 10.1093/bioinformatics/btl611